学术委员会、所务会、监督部门

学术委员会是研究所的最高学术领导机构，负责研究所重大学术事务的评议与审核。所务会作为日常决策机构，负责研究所重大事项的审议决策；监督部门则承担内部监督职能，确保科研活动的规范性和合规性。

科研部门

研究所的科研部门设置充分体现出激光制造研究领域学科交叉的特点，共设立9个科研部门和2个PI团队：其中科研部门包括科研部光机电算一体化部、激光半导体装备部、硬脆材料激光加工部、纳米功能材料部、激光医美部、超精密增材技术研发部、可再生能源部、先进农业技术部、宣传设计部；PI团队主要包括先进光学应用团队和超强激光团队。 极端光场制造科学与工程基础科学中心是根据国家自然科学基金委批准的基础科学中心项目，河南省科学院依托河南省科学院激光制造研究所设立非法人独立科研机构，主要聚焦极端光场制造领域国际前沿研究，中心下设管理职能部门和首席科学家团队。

管理部门

研究所设有完善的管理与支撑部门，包括科研事业办公室：统筹科研项目管理和学科建设；综合办公室：负责日常行政协调；成果转化办公室：推动科技成果转移转化；研究生管理办公室：负责统筹联培研究生事宜；安全生产委员会：保障科研生产安全；大型仪器设备共享中心办公室：统筹管理大型仪器开放共享； 激光所现行组织架构，既确保了机构运行的规范性和高效性，也保证了科学研究的专业性和创新性，能够为研究所开展高水平激光微纳加工与精密制造前沿研究提供有力的组织保障。